一、用数学模型拟合鸡胚胸腺生长发育的研究（论文文献综述）
李志朋[1]（2021）在《纳米化维生素E在肉鸡上应用效果的评估》文中研究指明
黄杨[2]（2021）在《关节钙化软骨层通透性观测以及T型钙离子通道介导其发育的机制研究》文中提出研究背景骨关节炎（osteoarthritis,OA）作为一种退行性关节疾病在临床上十分常见,常导致患者关节疼痛、活动受限甚至肢体残疾。OA发病机制复杂,但是作为一种累及整个滑膜关节的炎性疾病已是共识,而炎症的起始及循环扩大的过程尚不清楚。近年研究表明,OA的病因有可能来自软骨下骨,始发于软骨下骨的轻微炎症,在没有干预的情况下继续引发了软骨的炎症,然后不断的形成了炎症的正反馈循环,最终导致OA的各种病理和临床表现。如果能够在其炎症早期阻断这种循环,即可能够大大延缓OA的进程。生理状态下,关节软骨和软骨下骨之间缺乏交流,处于截然不同的两种微环境中。关节软骨内无血供,乏氧;软骨下骨血供丰富,有氧。钙化软骨层（calcified cartilage zone,CCZ）是位于关节软骨与软骨下骨之间的一层致密的界层结构,与毗邻组织连接处形成标志型的线性结构,即软骨侧的潮线（tide mark,TM）和骨侧的粘合线（cement line,CL）。钙化软骨层拥有的特殊形貌结构、组成成分赋予了钙化层独一无二的力学特性,使得关节在运动过程中,来着软骨的巨大力学冲击在钙化层得以衰减,还能够将来自软骨的剪切力变为压应力往软骨下骨传递。除此之外,钙化层还具有重要的屏障作用,这种屏障作用的缺失将开启了骨—软骨之间非正常的对话机制,其结果是引发了OA。然而,我们对于这一领域知之甚少,既往研究结果充满争议。因此,我们首先运用了各种技术手段以及模型来探索钙化层的屏障功能。但是要彻底明白钙化层的各种功能,还需要从钙化层的发生、发育的着手,从而过渡到理解病理状态下其重塑的机制。在钙化层形成过程中,我们认为软骨组织也经历了一个类似的软骨内成骨的过程,但是这一过程和完整的软骨内成骨又有一定的区别。无论如何,在软骨—骨（钙化层）转换过程中,软骨细胞肥大化、凋亡与转分化是软骨内骨化进程中的重要一环。大量证据表明,电压依赖性钙通道（voltage-dependent calcium channel,VDCC）广泛表达在骨软骨发育的各个阶段,并且这种时空特异性的分布对于骨软骨发育具有决定性作用。据此,本课题首先设计了一系列新的实验方案及技术手段,用于探查钙化层的通透性,旨在揭开钙化层的通透性在软骨发育,以及发生OA时的变化特点。然后以电压依赖型钙离子通道为切入点,进一步探究钙化层发育、重塑的分子机制。实验方法第一部分:原位观测活体小鼠关节成熟/不成熟钙化层的通透性1.1-8月龄小鼠钙化层组织学观察24只Balb/c雌性小鼠（1-8月龄,3只/月龄）,二氧化碳处死后对膝关节样本常规组织学处理,然后进行苏木精-伊红（HE）染色、番红O/固绿染色,显微镜拍照观察。Image J软件测算小鼠软骨厚度（软骨表面至潮线的距离）,钙化层的厚度（潮线至粘合线的距离）2.小鼠固定装置设计制造采用L型不锈钢板,在合适的位置安装两个机械臂。一个固定小鼠大腿,另一个固定自制的穿孔塑料培养皿。小鼠膝关节股骨髁暴露后穿过培养皿小孔,周围用胶水封闭。3.活体小鼠钙化层通透性观察实验84只Balb/c雌性小鼠分为未成熟钙化层组（1月龄,42只）和成熟钙化层组（6月龄,42只）,用罗丹明B溶液和四甲基罗丹明异硫氰酸葡聚糖溶液（TRITC-葡聚糖）作为示踪剂进行通透性测试。然后将动物分为4个亚组:成熟CCZ+罗丹明B、成熟CCZ+TRITC-葡聚糖、未成熟CCZ+罗丹明B、未成熟CCZ+TRITC-葡聚糖。扩散时间为1min、15min、30min、1h和2h。直接处死小鼠取下膝关节股骨远端样本（0min）作为空白对照,而股骨远端浸泡在罗丹明B或TRITC-葡聚糖中72h作为阳性对照。4.硬组织不脱钙荧光观测技术以及图像处理收集小鼠膝关节样本以后依次进行如下处理:冻干脱水、塑料包埋、切割打磨、共聚焦显微镜扫描、DAPI和荧光素钠复染、共聚焦显微镜二次扫描、两次扫描图像拟合。最后进行荧光值定位定量分析以及统计检验。第二部分:基于Mirco-CT和菲克定律观测人膝骨关节炎软骨钙化层的通透性1.OA样本收集和预处理根据纳入、排除标准,入选重度膝骨关节炎患者3例,待全膝关节置换手术完成后,立即用冰盒转移样本,根据关节软骨表面情况,钻取直径8mm的骨软骨柱（0-1级或者4级）。软骨下骨为基底面置入放入离心管,UV树脂胶进行密封、紫外线照射凝固,测试防水性。2.Mirco-CT扫描和图像分析于离心管内滴加0.5ml碘海醇,立刻放入Mirco-CT内进行高精度扫描。第一次扫描完成后,放入4℃冰箱内。以第一次扫描时间点为0h,然后在6h、24h、48h、72h再次进行扫描。扫描获得各时间点图像数据用3D slicer以及AMIRA软件进行3D重建,测算样本的CT值。3.扩散系数计算与数学建模根据菲克定律建立数学模型,解方程组求得解析解,不断将每个时间点距离——CT值带入方程,与实验数据相拟合,求出关节软骨及钙化层的扩散系数k。第三部分:在小鼠钙化层发育过程中软骨细胞T-VDCC表达特异性1.1-8月龄小鼠膝关节组织样本切片1-8月龄小鼠膝关节取材、常规石蜡包埋切片。2.小鼠膝关节标本免疫组化染色观察对不同发育阶段的小鼠膝关节样本切片行各亚型T-VDCC和软骨细胞肥大化、骨化相关标志蛋白免疫组化染色,拍照观察,计算阳性细胞率和细胞数量。第四部分:抑制Cav3.3后软骨细胞肥大化/成骨分化的分子机制1.小鼠原代关节软骨细胞分离、提取、体外培养培养,ATDC5软骨细胞系培养选用出生7-10天的Balb/c小鼠,二氧化碳处死后分离、提取、体外培养关节软骨中的软骨细胞。P2代小鼠软骨细胞用于实验处理和相关检测。ATDC5细胞系采用同样培养条件,进行体外培养扩增。2.小鼠原代软骨细胞、ATDC5软骨细胞系T-VDCC表达鉴定两种细胞进行T-VDCC三种亚型（Cav3.1,Cav3.2,Cav3.3）免疫荧光染色和western blot检测,明确三种亚型在这两种细胞中的表达情况。3.不同浓度Mibefradil抑制T-VDCC后对ATDC5软骨的影响在正常贴壁培养的ATDC5软骨细胞培养基中加入浓度为1μm、5μm、10μm、15μm的Mibefradil,48h后采用流式细胞仪行凋亡检测,阿尔新蓝、茜素红、碱性磷酸酶细胞染色、免疫荧光染色和western blot检测,查看不同浓度的Mibefradil抑制T-VDCC后,ATDC5细胞的凋亡情况,Cav3.1,Cav3.2,Cav3.3表达情况,以及软骨表型和肥大化表型蛋白标志物表达情况。4.si RNA抑制ATDC5细胞Cav3.3表达后细胞受到的影响根据三种亚型在ATDC5细胞中的表达情况,采用Cav3.3-si RNA转染正常贴壁培养的ATDC5细胞,抑制Cav3.3的表达,48h后行RT-PCR检测,确认Cav3.3是否被敲低;转染72小时以后进行流式细胞仪凋亡检测,阿尔新蓝、茜素红、碱性磷酸酶细胞染色、免疫荧光染色和western blot检测,查看Cav3.3表达降低以后,ATDC5细胞凋亡情况以及软骨表型和肥大化表型,成骨标志蛋白标志物表达情况。实验结果:第一部分:原位观测活体小鼠关节成熟/不成熟钙化层的通透性1.6月龄小鼠膝关节钙化软骨层发育成熟1-5月龄小鼠膝关节发育欠成熟,潮线不明显,各结构（软骨层、钙化软骨层和软骨下骨）层次边界不清。6月龄小鼠膝关节基本发育成熟,各个组织层次分界明显,潮线、粘合线清晰可见。7月、8月龄小鼠发育进一步成熟,软骨下骨结构更加致密。2.成熟的钙化层对罗丹明B有阻滞作用,未成熟钙化层则没有罗丹明B（476 Da）在成熟钙化层组的软骨层扩散达到饱和浓度的时间是30 min;在未成熟钙化层组的软骨层扩散达到饱和浓度的时间是1h。在体扩散2h后,发育成熟钙化层组,潮线以下没有罗丹明B的荧光,而未成熟钙化层组则能检测到。3.成熟钙化层对TRITC-葡聚糖具有阻滞作用,未成熟钙化层则没有对于成熟钙化层组和未成熟钙化层组,TRITC-葡聚糖（20k Da）在软骨层达到饱和浓度的时间分别未30 min和1h。扩散2h后,未成熟钙化层组软骨下骨有低浓度TRITC-葡聚糖分布,提示TRITC-葡聚糖通过未成熟钙化层组织向软骨下骨渗透,而成熟钙化层组则难以检测到TRITC-葡聚糖。第二部分:基于Mirco-CT和菲克定律观测人体骨关节炎钙化层的通透性1.4级OA钙化层与正常钙化层相比结构改变,通透性增加Micro-CT扫描提示,4级OA钙化层于0-1级相比,孔隙率增加,厚度也增加。在72h渗透以后,4级OA软骨下骨出现CT值增强,提示造影剂到达软骨下骨,但是正常组织软骨下骨增强不明显。2.OA进程中钙化层扩散系数改变通过数据和数学模型推算,0-1级OA钙化层扩散系数为0.03±0.01μm2/s,而4级OA钙化层扩散系数为0.12±0.04μm2/s。意味着发生4级OA时,软骨和骨之间的物质交换更容易。第三部分:在小鼠钙化层发育过程中软骨细胞T-VDCC表达特异性1.T-VDCC在小鼠钙化层成熟过程中的表达逐步下降随着小鼠膝关节发育,深层软骨组织（钙化层形成区域）逐渐钙化,软骨细胞Cav3.1、Cav3.2、Cav3.3的表达都逐渐下降,与之伴随的是COL 10和成骨标志蛋白osteocalcin在该区域的持续高表达。而表中层软骨细胞中Cav3.1、Cav3.2、Cav3.3持续表达,不随月龄增加而改变;COL 10、osteocalcin、MMP 13只有1月2月龄有阳性表达,之后随着月龄增长,不再表达。第四部分:抑制Cav3.3后软骨细胞肥大化/成骨分化的分子机制1.原代小鼠关节软骨细胞和ATDC5细胞中主要表达Cav3.3亚型原代原代软骨细胞和ATDC5细胞Cav3.1、Cav3.2、Cav3.3免疫荧光染色显示,两种细胞Cav3.3都出现很强的荧光,而Cav3.1、Cav3.2荧光则几乎不可见。三种离子通道western blot提示,Cav3.3条带清晰可见,而Cav3.1、Cav3.2几乎没有条带。2.Mibefradil抑制ATDC5细胞中Cav3.3的表达培养基中加入1μm、5μm、10μm、15μm的Mibefradil以后,PCR结果提示随着浓度增加,Cav3.1、Cav3.2、Cav3.3表达都下降,Cav3.3趋势最明显。western blot提示同样的结果,但是Cav3.1、Cav3.2同样的没有条带,Cav3.3表达其中在10μm浓度时最为显着,同免疫荧光结果一致。3.Mibefradil促进ATDC5细胞凋亡,软骨表型丢失并出现肥大化、成骨倾向培养基中加入1μm、5μm、10μm、15μm梯度浓度的Mibefradil以后,随着抑制剂浓度增加,流式细胞仪检测提示ATDC5细胞早期凋亡比例增加,阿尔新蓝染色变浅,而茜素红和ALP成骨标志染色则上升。western blot提示随着抑制剂浓度升高,COL 2、SOX 9、ACAN表达下降,COL 10、MMP 13、RUNX 2表达升高,其中5μm、10μm最为显着。培养基中加入10μm Mibefradil以后,免疫荧光染色提示COL 2、SOX 9表达下降,而COL 10、MMP 13、RUNX2表达上升。提示VDCC被抑制以后,ATDC5软骨表型丢失,出现成骨倾向。4.si RNA转染ATDC5细胞以后Cav3.3表达下调,软骨细胞表型改变,出现肥大化以及成骨分化倾向。构建Cav3.3-si RNA进行成功转染后,PRC,western bolt,免疫荧光染色提示ATDC5细胞中的Cav3.3表达出现下调。转染后,流失细胞仪检测示早期凋亡比例增加,阿尔新蓝、茜素红、碱性磷酸酶染色提示软骨表型丢失,表现成骨分化倾向。免疫荧光染色和western blot提示,COL 2、SOX 9表达下降,COL 10、MMP 13、RUNX2表达升高。5.抑制Cav3.3后软骨细胞表现成骨分化倾向依赖osteocalcin/NFAT途径ATDC5细胞Cav3.3表达下调后,免疫荧光和western blot提示其COL 1、非磷酸化NFATc2表达显着升高,osteocalcin,磷酸化NFATc2表达稍微升高,提示这种成骨倾向是Calcineurin/NFAT依赖途径。结论:1.小鼠出生后6月龄关节钙化层发育成熟,成熟的钙化层具有屏障功能。2.重度OA钙化软骨层重塑过程中,孔隙率增加和扩散系数增高,易化了关节软骨和软骨下骨之间的物质交换。3.小鼠钙化层在逐渐钙化成熟过程中,该区域软骨细胞T型电压依赖型钙离子通道表达逐渐下降,而肥大化、骨化表型蛋白表达上升。4.Cav3.3能促进软骨表型维持,抑制其功能和表达以后,ATDC5细胞出现Calcineurin/NFAT信号通路依赖的肥大化和成骨分化倾向。
李中浩[3]（2021）在《痰热清注射液对脑梗死后apelin信号通路及细胞凋亡和自噬的影响》文中研究表明背景:中风病与西方医学体系中的脑血管病相似,主要包括脑梗死和脑出血,具有高发病率、高致残率、高死亡率以及高复发率的特点,是临床中常见的神经科急危重症。静脉注射阿替普酶及近些年发展起来的机械取栓能够有效开通闭塞血管,改善患者临床预后。但部分患者由于存在禁忌症、就医不及时等原因未能接受到这些治疗。因此,需要寻找更多更有效的治疗方案。中医治疗中风病已有悠久的历史,改革开放以来形成了中风病诊断和辨证论治标准。随着对中风病认识的不断加深,王永炎院士强调在中风病中应注意毒邪的致病作用,建议在治疗时加入解毒类方药。痰热清注射液由金银花、黄芩、连翘、水牛角和熊胆粉组成,长于清热解毒,在临床上广泛的应用于呼吸系统疾病的治疗。研究人员发现,伴有肺部感染的中风病患者使用痰热清注射液后,不仅咳嗽、发热等症状得到改善,其神经功能的恢复也较快。痰热清注射液的组方思路与安宫牛黄丸、清开灵注射液、醒脑静注射液相似,因此,从毒邪致病的角度推测痰热清注射液解毒开窍的功效,可能对中风病也有一定的治疗作用。一些早期的临床研究也发现,痰热清注射液能够促进脑梗死和脑出血患者的神经功能恢复。目的:探索痰热清注射对中风病的疗效及其治疗机制。方法:1.在临床研究中,我们采用系统评价和荟萃分析的方法,对已发表的关于痰热清注射液治疗中风病的临床文献进行筛选和分析。检索万方、中国知网、中国生物医学文献数据库和PubMed等数据库中截止到2021年1月1日收录的关于痰热清注射液治疗中风病的随机对照临床试验。按照纳入和排除标准筛选出符合要求的文献,进行荟萃分析,同时对文献的偏倚风险进行评价。2.在实验研究中,我们首先采用网络药理学的方法,对痰热清注射液中有效成分治疗中风病的生物学机制进行探索。根据已发表的文献收集痰热清注射液中的已检测到的化合物成分,计算这些化合物的QED值,选择其中大于0.18的做为潜在有效成分。检索PubChem中这些有效成分的药物靶标。将这些靶标与数据库中检索到的已知治疗中风病的药物靶标做交集,得到痰热清注射液治疗中风病的药物靶标。分析这些药物靶标之间的蛋白-蛋白相互作用关系并进行生物学注释。然后,利用大鼠大脑中动脉栓塞法制作脑梗死动物模型,通过2,3,5-氯化三苯基四氮唑染色评价不同剂量痰热清注射液对大鼠脑梗死体积的影响。用苏木素-伊红染色和尼氏染色评价梗死模型的病理学特征。最后,使用WB和免疫荧光的方法检测从网络药理学得出的apelin信号通路及其下游的细胞凋亡和自噬相关蛋白的表达。结果:1.系统评价和荟萃分析中共纳入了 11篇文献,涉及955例患者。荟萃分析结果显示,痰热清注射液对降低中风病或伴肺部感染的患者美国国立卫生研究院卒中量表评分均有一定的帮助作用,与对照组相比具有显着的统计学差异（MD=-5.45,95%CI:-10.82～-0.09。MD=-2.37,95%CI:-3.49～-1.26,P<0.05）。对提高患者功能独立性评分（MD=14.90,95%CI:8.84～20.96,P<0.05）、肢体运动功能（MD=7.39,95%CI:2.74～12.04,P<0.05）有一定的帮助作用,且与对照组相比具有显着的统计学差异。虽然对患者日常生活能力评分的提高有一定的帮助作用,但与对照组相比无显着的统计学差异（MD=12.95,95%CI:-1.02～26.92,P<0.05）。纳入研究的存在较高的偏倚风险,且存在较大的异质性。2.在网络药理学研究中,痰热清注射液的81个有效成分共检索到663个药物靶标,在有效成分-药物靶标网络图中,度值最大的有效成分为绿原酸,度值最大的药物靶标为核因子E2相关因子2。其中有116个为治疗中风病的药物靶标。这116个药物靶标蛋白-蛋白相互作用中重要的靶点有白蛋白、细胞肿瘤抗原p53、白细胞介素-8等。生物学功能注释结果显示,这些靶点涉及胆汁分泌、药物代谢、化学致癌、肝病和apelin信号通路等227个通路;脂肪酸合成与代谢、外来化学物质代谢和细胞对药物反应等3258个生物过程;核受体活性、血红素结合反应、丝氨酸型肽酶活性等442个分子功能;排名靠前的有核苷酸活化蛋白激酶复合物、膜筏、突触后膜等222个细胞组分。在脑梗死大鼠模型中,可见梗死部位水肿,空泡形成,细胞死亡。而腹腔注射液低剂量痰热清注射液（2.5ml/kg,每6小时1次）能够明显减少大鼠脑梗死24小时后的梗死体积,与模型组相比具有显着的统计学差异（P<0.05）。WB结果显示,使用痰热清注射液后APJ/PI3K/AKT/mTOR信号通路的蛋白含量与模型组相比显着增加;凋亡相关蛋白BCL2/BAX 比例显着上升,caspase8蛋白含量显着减少;自噬相关蛋白LC3 Ⅱ/LC3Ⅰ比例显着下降;NeuN蛋白含量显着增加,GFAP蛋白含量显着减少。蛋白改变具有显着的统计学差异（P<0.05）。结论:痰热清注射液对中风病特别是脑梗死有一定的治疗作用,其治疗脑梗死的机制可能与激活apelin信号通路,抑制细胞凋亡和自噬等有关。但这些研究较为粗浅,需要更高质量的临床和基础研究来明确痰热清注射液对中风病的临床疗效和药理机制。
黄璇,姚亚铃,李闯,张旭,蒋桂韬,胡艳,戴求仲[4]（2020）在《3～8周龄攸县麻鸭苏氨酸需要量》文中研究指明本试验旨在研究饲粮苏氨酸水平对3～8周龄攸县麻鸭生长性能、免疫器官指数、血清生化和抗氧化指标的影响,以确定3～8周龄攸县麻鸭的苏氨酸需要量。选择300只15日龄、体重相近的攸县麻鸭,随机分成5组,每组6个重复,每个重复10只。各组（Ⅰ～Ⅴ组）饲粮苏氨酸水平分别为0.54%、0.60%、0.66%、0.72%和0.78%。试验期42 d。结果显示:1)Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组的末重和平均日增重均显着高于Ⅰ组（P <0.05）;Ⅰ组料重比最高,且显着高于其他各组（P <0.05）。2)各组之间法氏囊指数、脾脏指数和胸腺指数均无显着差异（P>0.05）。3)Ⅲ和Ⅳ组的血清球蛋白含量显着高于Ⅰ组（P<0.05）。Ⅳ组的血清尿酸含量最低,且显着低于Ⅰ和Ⅱ组（P<0.05）。4)Ⅲ和Ⅳ组的血清丙二醛含量显着低于Ⅰ组（P<0.05）,Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ组血清总抗氧化能力显着高于Ⅰ组（P<0.05）。5)以末重、平均日增重、料蛋比和血清丙二醛含量为判别指标,通过二次曲线模型估测得出饲粮适宜苏氨酸水平分别为0.68%、0.69%、0.69%和0.71%。由此可见,饲粮苏氨酸水平为0.60%时即可满足3～8周龄攸县麻鸭生长发育需要,但饲粮苏氨酸水平为0.68%～0.71%时可获得较佳的生长性能、血清生化指标和抗氧化能力。因此,在本试验条件下,3～8周龄攸县麻鸭饲粮适宜苏氨酸水平为0.68%～0.71%。
付苏凝[5]（2020）在《基于靶向代谢组学研究方法探究芍药内酯苷通过调节肠道菌群抗抑郁的机制》文中认为抑郁症（Depression）是一种严重的情感障碍性精神疾病,以显着而持久的心境低落为主要临床特征。目前临床使用的合成抗抑郁药物虽然有一定的疗效,但起效迟缓、疗效低或有强烈的副作用。探究抑郁症复杂的发病机制,为寻找治疗抑郁症的药物作用新靶点、开发出疗效更好和副作用更低的抗抑郁药物成为当今研究的热点。本课题组在前期工作中分别探究了芍药总苷、芍药苷和芍药内酯苷的抗抑郁效果,发现三者均有一定的抗抑郁作用,芍药内酯苷的抗抑郁作用优于芍药苷和芍药总苷,且抗抑郁效果具有剂量依赖性。本次研究是在此基础上采用经典的大鼠慢性温和不可预知性应激（Chronic unpredictable mild stress,CUMS）抑郁症模型,考察芍药内酯苷的快速抗抑郁作用,并运用新一代靶向代谢组学（Next-generation targeted metabolomics）技术,研究分析大鼠海马组织中和肠道内的代谢产物水平,揭示芍药内酯苷抗抑郁的分子药理学机制。通过构建慢性温和不可预知性应激抑郁大鼠模型,分别将抗抑郁药氟西汀和快速起效抗抑郁药氯胺酮作为阳性药对照,考察芍药内酯苷对CUMS模型大鼠体重、1%糖水偏好实验和开放场（Open field test,OFT）实验中的抗抑郁效果。结果显示,在大鼠CUMS模型中,连续给予芍药内酯苷7天后,可明显逆转CUMS模型大鼠体重的下降和1%糖水偏好的减少,以及开放场实验中活动总距离和直立次数的减少;而连续给药7天的氟西汀（10 mg/kg）组对模型大鼠的1%糖水偏好影响,与CUMS组相比无显着性差异。单次给药氯胺酮（10 mg/kg）和芍药内酯苷（7 mg/kg）均可明显逆转CUMS模型大鼠1%糖水偏好的减少,且氯胺酮和芍药内酯苷之间没有统计学差异,表明芍药内酯苷具有快速起效的抗抑郁作用。开展了芍药内酯苷的药代动力学研究,大鼠灌胃给予芍药内酯苷（7 mg/kg）后,在预定的时间点眼眶后静脉丛取血,在每个时间点收集血液后处死大鼠并迅速分离大鼠脑海马组织,采用LC-MS/MS法测定血浆和海马组织中芍药内酯苷的含量变化。结果显示,大鼠在灌胃后5 min就可以在血浆中检测到芍药内酯苷,大鼠海马区芍药内酯苷浓度在45 min时达到峰值(Tmax)。药代动力学结果进一步表明了芍药内酯苷的快速起效作用。开展了芍药内酯苷对CUMS抑郁模型大鼠抗抑郁机制研究。大鼠海马组织靶向代谢组学研究结果显示,芍药内酯苷可以恢复海马组织中的代谢紊乱,调节代谢产物水平,调控苯丙氨酸、酪氨酸、谷氨酸和色氨酸代谢通路。蛋白表达（Western Blot）研究结果显示,在大鼠海马和伏隔核（NAc）区,与CUMS模型组相比,芍药内酯苷连续给药7天后可快速上调环磷腺苷效应元件结合蛋白（c AMP-response element binding protein,CREB）、磷酸化的c AMP反应原件结合蛋白（Phosphorylated Camp Response Element Binding Protein,p CREB）、酪氨酸激活酶B（Tropomyosin-related kinase B receptor,Tr KB）和磷酸化的酪氨酸激活酶B（phosphorylated tropomyosin related kinase B,p Tr KB）的表达;在海马区,芍药内酯苷给药7天后脑源性神经营养因子（Brain derived neurotrophic factor,BDNF）表达显着上调,氟西汀治疗组则没有影响,另外,芍药内酯苷显着下调N-甲基-D-天冬氨酸受体（N-methyl-D-aspartate receptor,NMDA）B亚型谷氨酸受体离子型（NMDA Receptor 2B,GLu N2B）的表达水平,发挥了与氯胺酮类似的作用。大鼠粪便靶向代谢组学研究结果显示,CUMS诱导大鼠肠道菌群代谢失调,给予芍药内酯苷治疗后使得大鼠整体肠道微生物代谢趋向正常代谢,调节慢性应激诱导的肠道代谢紊乱,调控花生四烯酸和酪氨酸等代谢通路。为了进一步验证肠道微生物在芍药内酯苷抗抑郁效果中的作用,我们通过灌胃和饮水对大鼠肠道菌群进行广谱抗生素干预。构建了抗生素诱导的肠道微生物耗竭（Antibiotic-induced microbial depletion,AIMD）模型。以粪便细菌DNA负荷和肠道微生物代谢产物水平较正常对照组大鼠显着降低,以及AIMD组的苯甲酸含量显着减少为评估指标,表明肠道微生物组清除成功。然后,使用CUMS抑郁症模型大鼠评估AIMD对芍药内酯苷抗抑郁活性的影响。结果显示,OFT检测中,芍药内酯苷治疗的AIMD组仅部分校正了由慢性应激引起的直立次数和活动总距离的减少。海马靶向代谢组学结果显示,AIMD部分消除了芍药内酯苷对CUMS模型大鼠海马代谢紊乱的修复,影响海马的色氨酸、酪氨酸和花生四烯酸代谢通路。与芍药内酯苷处理的普通CUMS抑郁症模型大鼠相比,AIMD导致CUMS抑郁症模型大鼠对芍药内酯苷治疗的响应显着不同。结论,芍药内酯苷可以作为一种潜在的快速抗抑郁候选药物。芍药内酯苷的主要抗抑郁作用机制为:芍药内酯苷通过调节酪氨酸、色氨酸、谷氨酸、苯丙氨酸和花生四烯酸代谢通路来发挥抗抑郁作用;芍药内酯苷可以恢复由CUMS诱导的代谢紊乱,其原因是肠道微生物及其代谢酶将芍药内酯苷分解转化为代谢产物苯甲酸,恢复肠道菌群失调,调节肠道微生物组成和功能,提高芍药内酯苷在体内的生物利用度,从而发挥抗抑郁效果。
王俊强[6]（2020）在《核心内源性网络假说与动力学方法在解析胰腺细胞命运决定和调控网络中的应用》文中提出发育中不同胰腺细胞的成熟由一系列有序的细胞命运决定所协调。在胰腺细胞的经典分化层次中,多能祖细胞（multipotent progenitors,MP）首先分化成尖端（tip）细胞和躯干（trunk）细胞,并随后分别成熟为腺泡（acinar）细胞和内分泌（endocrine）或导管（ductal）细胞。然而,细胞谱系示踪实验显示胚胎期胰腺祖细胞在tip区域和tip-trunk临界区域中是高度异质的。胰腺祖细胞从多能性到单能性的命运决定没有得到充分的表征。另外,胰腺发育早期一定比例的acinar谱系的PTF1A+祖细胞与ductal谱系的SOX9+祖细胞可以发生谱系转换,成熟为其它谱系的细胞。胰腺祖细胞的异质性与谱系转换无法用已经建立的经典分化路径解释。相对于细胞谱系示踪方法和单细胞测序数据分析方法,基因调控网络动力学模型可以更好地反映出细胞命运决定中的逻辑性和复杂性。然而,由于基因调控的错综复杂,根据已知的分子生物学知识,我们很难得到器官或组织发育的完整基因调控网络。而基于生物信息学或统计学方法等从测序数据推断的基因调控网络,由于其准确性低的缺点,不能从动力学模拟中给出可靠的预测。这需要我们提出可以用于模拟与预测细胞命运决定的“简化”的调控网络模型。分子—细胞核心内源网络假说最初用来解释癌症的发生机制。本论文中,我们将核心内源网络假说推广到发育过程,提出发育的核心内源性网络假说。发育的核心内源性网络假说与定量计算框架使得复杂的细胞命运决定可以在核心基因调控网络水平上被预测出来。基于发育的核心内源性网络假说,我们解析胰腺细胞的复杂命运决定。我们构建了调控胰腺细胞命运决定的核心调控网络,并使用动力学模型量化网络的动力学特性。随后,从这些动力学特性中,一个之前并未阐明的胰腺发育景观被解析出来。在发育景观中,模型不仅重现了已知的胰腺细胞类型,而且预测出一系列之前未知的祖细胞类型——tip progenitor（TiP）、trunk progenitor（TrP）、late endocrine progenitor（LEP）和 acinar progenitor/acinar progenitor 2（AciP/AciP2）。进一步分析表明,TrP和LEP介导内分泌谱系成熟,而TiP、AciP、AciP2和TrP介导外分泌acinar与ductal谱系成熟。通过分析小鼠胰腺single-cell RNA-Sequencing（scRNA-Seq）数据,我们验证了这些新的祖细胞类型的存在。据我们所知,这是第一次获得的与经典分化层次相对应的更完整的胰腺细胞命运决定路径。另外,我们发现一组超过渡态介导了祖细胞TiP与TrP的谱系转换,它们自然地解释了具有谱系偏向性的祖细胞的“多能性”。此外,模型预测了由腺泡细胞向导管细胞转换的两条并行的谱系转换路径,它们分别由过渡态和超过态介导。在小鼠胰腺scRNA-Seq数据中,我们验证了这些过渡态和超过渡态的存在。核心内源性网络动力学性质也完整地揭示了不属于经典分化层次的胰腺谱系转换路径。阐明基因调控网络的结构对于从机理上理解发育过程和疾病进展具有重要意义。随着单细胞测序技术的发展,出现了适用于scRNA-Seq数据的不同基因调控网络推断方法。基因转录过程的生化反应动力学通常是非线性的,基于线性模型的推断方法无法捕获非线性效应,而若干基于非线性调控动力学的模型仅适用于小型调控网络的推断。在这里,我们设计了一种新的非线性动力学方法,它基于Sigmoidal函数模拟成对基因间的转录调控动力学,进而从单细胞基因表达数据中推断调控关系。这一方法适用于推断数百个基因组成的调控网络。应用此方法,我们来推断胰腺发育和其他细胞分化过程中的基因调控网络。结果表明,即使在线性相关关系非常弱的情况下,此方法也可以从非线性效应中准确地推断出基因间的调控关系。与若干其他方法相比,在不同数据集中,此方法给出最高的曲线下面积（area under the curve,AUC）值,表明它具有较强的预测能力。综上所述,核心内源性网络假说与动力学方法在解析细胞复杂命运决定和调控网络中具有重要应用价值。
付劢[7]（2020）在《鸡胚多肽调节免疫力功能的初步探究》文中指出免疫力低下是现代社会中人们普遍存在的一种亚健康状态,人体在此状态下易受病原菌入侵,使机体受到损害。免疫应答作为重要的人体保护屏障,与人体的健康有着直接的关系,免疫力强弱对于人体健康具有非常重要的意义。通过研究具有免疫调节肽的天然食物,筛选出其中的功能性物质,可制成保健品或营养品来提高人体免疫力。鸡胚蛋作为一种民间药膳补品,因营养丰富,口感滑嫩等优点,有长久的被食用历史。研究报道表明,鸡胚蛋匀浆物、鸡胚蛋水溶物、鸡胚蛋脂溶物,均对调节免疫力起促进作用。本文以鸡胚蛋为原料,通过蛋白质提取、优化水解工艺、鸡胚多肽分离获得不同分子量大小的鸡胚多肽,探究其对于免疫力的增强和调节作用。本文以13日龄的鸡胚蛋为原料,提取蛋白后获得鸡胚粗蛋白,通过单因素和响应面实验探究枯草杆菌蛋白酶、碱性蛋白酶、木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶、胰蛋白酶在内的五种蛋白酶的酶解效果,优化菠萝蛋白酶水解鸡胚的酶解工艺,其中水解度最高的组合为在pH为6、酶与底物比3%、酶解温度45℃的条件下,使用菠萝蛋白酶酶解鸡胚,酶解时间为7 h。在优化鸡胚蛋酶解工艺的基础上,以最优工艺条件酶解鸡胚蛋后获得鸡胚多肽,利用超滤和透析技术,获得分子量为小于1 kDa、1-5 kDa、5-10 kDa、大于10 kDa的四组鸡胚多肽。调节四个组分的浓度,给予小鼠巨噬细胞,空白对照组给予完全培养基,与对照组实验相比,不同浓度的四组鸡胚多肽在细胞增殖和中性红吞噬的实验中,均促进小鼠巨噬细胞增殖并增强巨噬细胞吞噬活性。将小鼠巨噬细胞RAW264.7分为三组,分别给予完全培养基、脂多糖（LPS）、脂多糖和不同浓度鸡胚多肽。LPS可抑制细胞免疫功能,促进巨噬细胞NO的释放,及NF-κB、Toll-like Receptors免疫通路中相关免疫因子（iNOS、IL-6、IL-10、TNF-α、TLR4）的基因表达。给予鸡胚多肽刺激巨噬细胞的实验组与脂多糖刺激的实验组比较,巨噬细胞NO的释放量、iNOS mRNA、IL-6mRNA、IL-10 m RNA、TNF-αm RNA、TLR4 m RNA的基因表达回调,说明鸡胚多肽对于增强免疫力起促进作用。
冯宇隆[8]（2020）在《维生素A对北京鸭生长发育和肠道健康的调节作用与机理研究》文中进行了进一步梳理本文通过3个体内试验研究了维生素A对北京鸭生长发育、肠道发育以及损伤修复的影响及调控机制,并通过体外试验研究了视黄酸（ATRA）对IPEC-J2细胞增殖和迁移的影响。试验一旨在研究日粮维生素A添加对121日龄北京鸭生长性能、屠宰性能、组织视黄醇含量以及血浆生化指标的影响,并估测最佳需要量。本试验共8个处理（0、500、1000、1500、2500、3500、7000和14000IU/kg）,每个处理8个重复,每个重复8只鸭。结果显示,与饲喂基础日粮组相比,维生素A添加显着提高了121日龄北京鸭的日增重、日采食量、血浆和肝脏视黄醇浓度、血浆甘油三酯和胸肌率（P<0.05）,显着降低高密度脂蛋白胆固醇和总胆固醇含量（P<0.05）。以血浆视黄醇浓度、血浆甘油三酯和日增重为评定指标,基于直线折线模型和二次曲线模型的联合应用,121日龄北京鸭维生素A的需要量为3341.66347.6IU/kg。试验二旨在研究日粮维生素A添加对121日龄北京鸭肠粘膜发育的影响及调控机制。本试验利用试验一建立的北京鸭维生素A缺乏和充足模型,21日龄时,采集十二指肠和空肠组织用于组织切片,采集十二指肠粘膜样品,用于酶活性测定及利用iTRAQ-PRM白质组学技术鉴定粘膜蛋白表达变化。结果显示,维生素A显着增加十二指肠的绒毛高度、绒毛面积和杯状细胞数量,显着增加空肠绒毛高度、V/C、绒毛面积和杯状细胞数量（P<0.05）,但对回肠各个形态指标影响不显着（P>0.05）;维生素A显着提高了十二指肠碱性磷酸酶和二糖酶活性和空肠蔗糖酶和麦芽糖酶活（P<0.05）;共筛选到147个差异蛋白质,其中涉及维生素A代谢的差异蛋白质4个、细胞迁移的差异蛋白23个、细胞增殖的差异蛋白10个、粘膜免疫相关差异蛋白4个,代谢相关的39个。研究表明,维生素A添加促进十二指肠和近端空肠粘膜的发育,通过调控ECM、Arp2/3及RhoA通路相关蛋白促进肠上皮细胞主动迁移,通过延长细胞周期抑制肠上皮细胞增殖,此外维生素A调控肠上皮细胞内脂质代谢且促进脂质跨膜吸收转运。试验三旨在研究视黄酸（ATRA）对肠上皮细胞迁移和增殖的影响及分子机理。IPEC-J2细胞在视黄酸缺乏和视黄酸添加（3、6和12μM）的培养基中培养。利用细胞迁移实验和Alarmar BlueTM试验分别测定细胞迁移和细胞增殖,利用RT-qPCR技术检测与细胞迁移和细胞增殖相关的基因表达丰度,利用Western blot和双荧光素酶试验检测ATRA对ERK/MAPK信号通路的影响。结果显示,ATRA显着增加上皮细胞的迁移率并上调与迁移相关的标志基因,如ZO-1、ECAD、ICAM-1和Occuldin（P<0.05）;ATRA显着抑制了细胞增殖活性并下调了与细胞增殖密切相关的基因,如PCNA、Cyclin B1和Cyclin D1（P<0.05）;ATRA显着增加ERK1/2的磷酸化水平,但显着抑制了ERK1/2下游转录因子的活性,如Elk-1、c-Jun、Creb和Chop（P<0.05）。结果表明ATRA促进IPEC-J2细胞增殖可能与ERK1/2信号通路的激活有关,而ATRA抑制肠上皮细胞增殖是否与ERK1/2与其下游转录因子的解偶联有关有待进一步研究。试验四旨在探究日粮维生素A添加是否缓解LPS诱导的北京鸭生产性能降低和肠道损伤。采用2x3两因子随机试验设计,即2个攻毒处理（注射LPS或生理盐水）和3个维生素A水平（0,7000,14000 IU/kg）,共6个处理,每个处理7个重复,每个重复6只鸭,分别在第14、16和18天腹腔注射LPS或生理盐水,饲养周期为121d。结果显示,LPS注射显着降低了21日龄北京鸭末重、1421日龄平均日增重和平均耗料量（P<0.05）,然而日粮添加维生素A显着提高了21日龄北京鸭末重、1421日龄平均日增重、平均耗料量和料重比（P<0.05）;LPS注射显着提高谷草转氨酶活性,显着降低血浆白蛋白含量（P<0.05）,日粮维生素A添加显着降低碱性磷酸酶活性和总胆汁酸含量（P<0.05）;LPS注射显着降低十二指肠绒毛高度、绒毛面积和蔗糖酶活性（P<0.05）及空肠绒毛面积和麦芽糖酶活性（P<0.05）,维生素A添加显着增加十二指肠和空肠绒毛高度、V/C、绒毛表面积和麦芽糖酶活性（P<0.05）。通过体外试验发现视黄酸可缓解LPS对上皮细胞迁移的抑制且提高与迁移密切相关的ERK1/2磷酸化水平;视黄酸可通过抑制NF-kB的激活抑制LPS引起的炎症反应。这些研究结果表明,维生素A显着提高LPS注射后北京鸭生产性能,且能有效缓解LPS对肝脏和肠粘膜的损伤。以上研究表明,日粮维生素A添加能显着改善前期北京鸭生产性能,维生素A添加促进十二指肠及其近端空肠粘膜的发育,维生素A通过调控肠上皮细胞主动迁移、细胞增殖、免疫以及代谢维持粘膜健康;ATRA能显着提高IPEC-J2细胞磷酸化ERK1/2和未磷酸化ERK1/2的比值,而ERK1/2磷酸化水平的升高可能是ATRA刺激肠上皮细胞迁移的机制之一,维生素A能有效缓解LPS造成的生产性能下降和肠粘膜的损伤。
于小雨[9]（2020）在《贴壁细胞迁移对于不同曲率信号的响应》文中进行了进一步梳理细胞所处的微环境在调节细胞形态变化和生理功能等方面起着至关重要的作用,由细胞外基质（Extracellular Matrix,ECM）以及能够促进和调节细胞功能的生物化学分子组成。在过去十几年的研究中,越来越多的实验表明,生物细胞所处的微环境的力学和几何信号在调控细胞行为和功能等方面,和传统的生物化学因素一样至关重要。也有很多实验观察到体内各种微/纳米拓扑结构引导下的细胞迁移以及肿瘤细胞的侵袭/转移过程。生命体的胚胎发育,组织形态,甚至是肿瘤细胞的侵袭等过程,曲率环境都有很重要的参与。近年来已有很多研究通过构建微沟槽、微柱等多种拓扑结构的微表面,初步探讨了细胞尺度地形结构对细胞行为的影响。细胞对生化、机械和拓扑信号的积极响应影响了细胞形态及其活动。细胞形态的变化主要是由肌动蛋白纤维的粘着以及相关的内力变化引起的,肌动蛋白纤维的粘着力是根据ECM或邻近细胞的刺激而发生的。了解ECM中细胞力学信号的传递以及贴壁细胞对ECM的几何信号刺激下的活性/反馈的物理学机制,对于理解许多像伤口愈合、组织生长/再生/发育等生物过程是很重要的。细胞已经进化出多种机制来很好地适应它们的环境。虽然已经有很多研究解释了细胞在二维拓扑结构上运动的机制,但是体内的真实环境大多都不是理想实验条件下的二维平面,所以研究细胞在三维空间里二维曲面上的运动,解释细胞在该拓扑结构下细胞运动的具体物理机制变得尤为重要,因为ECM的机械和几何信号通常更容易控制和改变,并且产生的效能可能比生物化学因子或遗传物质操作更永久。这里我们选择研究的是,贴壁细胞对不同曲率信号的迁移响应。拓扑基底的构建是研究三维几何结构对细胞运动影响的重要基础。微纳米加工技术在生物微流控等方面的广泛应用,为构建不同ECM结构提供了可能性。在这里,我们选择具有生物相容性较好和强透光率性质的聚二甲基硅氧烷（Polydimethylsiloxane,PDMS）来制备几种不同几何信号的基底,通过设计较高轴长（300微米）的圆柱,以提供给细胞足够的运动空间,和设计不同曲率半径的圆柱来控制曲率变化,从而实现对于基底几何性质的改变。在模板的制作上,我们对比使用了两种制作方法,根据实验需要,选择了一种能够制备出平整光滑表面的模板制作方法,并希望在以后类似的实验中得到推广。在细胞的选择上,我们首先选择了具有较快运动速度且带有绿色荧光蛋白的人体乳腺囊肿细胞（上皮细胞,MCF-10A-GFP）,用于更好的标定细胞的位置。随着研究进程的推进,以及证明运动规律的普适性,我们还选择了具有较强应力纤维的小鼠胚胎成纤维细胞（成纤维细胞,NIH-3T3）来进行相同的细胞实验。通过长时间的细胞运动轨迹追踪,我们进行了大量的数据分析。并在此基础上还进行了细胞内细胞骨架微观结构的标定成像,用于更好地解释在曲率体系下,细胞运动的变化。我们实验结果显示这种迁移行为明显不同于细胞在平面上的运动。在平面上,细胞通常会以随机运动的模式向所有方向迁移,细胞在各个方向上出现的概率均等。而在不同曲率的圆柱上,细胞会明显的出现运动方向的偏向性。由此展示了细胞的一种新的能力,我们称之为细胞运动的“曲率趋向性”,这使得细胞能够对细胞尺度不同的曲率信号作出反应。我们发现曲率信号不仅能加快细胞运动,而且也影响了细胞对于不同运动方向的选择,还在一定程度上降低了细胞运动方向的相关性。综上所述,本研究开发了构建细胞运动的三维曲率模型,总结不同细胞在不同曲率基底上运动变化的规律,并尝试用物理模型及胞内本身的微观结构来解释其内在机制。这也将为生命科学研究和临床医疗应用,特别是再生医学和组织工程等领域的发展提供新的应用理论基础。
苏晓春[10]（2020）在《基于进化多目标优化的疾病模块识别算法研究》文中进行了进一步梳理复杂疾病是由疾病相关基因引起的生物系统功能障碍所引发,其发生发展过程受多个基因的相互作用影响。目前,基于生物分子网络的疾病模块挖掘与分析已成为揭示复杂疾病作用机理的最有效的方法之一。然而,现有的疾病模块识别通常是基于多样本构建网络进行挖掘,从而导致识别到的疾病模块难以在单个样本中体现,难以应用于疾病诊断。本文首先基于个体特异性网络设计进化多目标优化算法用于寻找与疾病相关性强且连接紧密的疾病模块,进而以挖掘具有较好分类效果的疾病模块为目标,提出了可有效用于诊断的疾病模块挖掘方法。本文的主要研究工作如下:（1）本文提出了基于个体特异性网络的进化多目标优化疾病模块识别算法（EMODMI）。首先,EMODMI算法基于单个疾病样本构建个体特异性网络。其次,基于个体特异性网络设计了多目标进化算法,该算法同时优化模块与疾病关联强度和模块内部紧密度,并为疾病模块识别问题设计了适用的初始化和种群更新指导策略。最后,提出模块分数用于评价疾病模块优劣,并依据模块分数从由多目标进化算法所得的一组非支配解集中选出最终的疾病模块。在实验阶段,在两个哮喘数据集上与四个传统的疾病模块识别算法对比分析了EMODMI算法的性能优势,并验证了识别到的疾病模块的生物学意义。（2）本文提出了基于进化多目标优化的可分类疾病模块识别算法（EMOCDMI）,以挖掘除具备与疾病相关性强和连接紧密等特征之外,还便于区分疾病与正常样本的疾病模块。首先,EMOCDMI算法继承了（1）的网络构造策略,基于单个疾病样本构建个体特异性网络。其次,设计多目标进化算法挖掘疾病模块,与EMODMI不同之处在于本算法将分类错误率增设为优化目标,并基于个体特异性网络设计了基于相互作用的分类特征构造策略用于目标函数评估,还提出了随机性交叉算子和修复性变异算子以避免算法陷入局部最优。最后,依据分类错误率从非支配解集中选出最优疾病模块。通过与一个可分类疾病模块识别算法和四个疾病诊断算法在八个数据集上的实验结果对比表明,EMOCDMI算法可以有效的识别能够区分疾病和正常样本的疾病模块,且基于模块信息区分疾病和正常样本的效果要优于传统的基于分子的疾病诊断。
二、用数学模型拟合鸡胚胸腺生长发育的研究（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、用数学模型拟合鸡胚胸腺生长发育的研究（论文提纲范文）
（2）关节钙化软骨层通透性观测以及T型钙离子通道介导其发育的机制研究（论文提纲范文）
| 中英文缩写览表 |
| 英文摘要 |
| 中文摘要 |
| 第一章 前言 |
| 第二章 原位观测活体小鼠关节成熟/不成熟钙化层的通透性 |
| 2.1 实验材料 |
| 2.2 实验方法 |
| 2.3 结果 |
| 2.4 讨论 |
| 2.5 结论 |
| 第三章 基于Mirco-CT和菲克定律观测人膝骨关节炎软骨钙化层的通透性 |
| 3.1 实验材料 |
| 3.2 实验方法 |
| 3.3 结果 |
| 3.4 讨论 |
| 3.5 结论 |
| 第四章 在小鼠钙化层发育过程中软骨细胞T-VDCC表达特异性 |
| 4.1 实验材料 |
| 4.2 实验方法 |
| 4.3 实验结果 |
| 4.4 讨论 |
| 4.5 结论 |
| 第五章 抑制Cav3.3 后软骨细胞肥大化/成骨分化的分子机制 |
| 5.1 实验材料 |
| 5.2 实验方法 |
| 5.3 实验结果 |
| 5.4 讨论 |
| 5.5 结论 |
| 全文结论 |
| 参考文献 |
| 文献综述1 关节钙化软骨层研究进展 |
| 参考文献 |
| 文献综述2 电压依赖性钙离子通道在骨软骨细胞中的作用 |
| 参考文献 |
| 博士研究生期间发表的论文以及成果 |
| 致谢 |
（3）痰热清注射液对脑梗死后apelin信号通路及细胞凋亡和自噬的影响（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 符号说明 |
| 文献综述 |
| 综述一 从毒论治中风病的研究进展 |
| 一、中风病中西医论治现状 |
| 二、从毒论治中风病的理论基础 |
| 三、解毒法治疗中风病的当代实践 |
| 四、常用解毒类方药治疗中风病的现代研宄 |
| 五、总结和展望 |
| 六、参考文献 |
| 综述二 痰热清注射液成分、治疗机制及临床应用的研究进展 |
| 一、痰热清注射液出自名家，历经考验，疗效确切 |
| 二、痰热清注射液含有多种化学成分 |
| 三、痰热清注射液的药理作用及安全性研究进展 |
| 四、痰热清注射液的临床应用进展 |
| 五、痰热清注射液从解毒切入治疗中风的研宄现状和展望 |
| 六、参考文献 |
| 前言 |
| 临床研究 |
| 痰热清注射液治疗中风病的系统评价和荟萃分析 |
| 1 引言 |
| 2 方法 |
| 3 结果 |
| 4. 讨论 |
| 实验研究 |
| 研究一 利用网络药理学探讨痰热清注射液治疗中风病的生物学机制 |
| 1 引言 |
| 2 方法 |
| 3 结果 |
| 4 讨论 |
| 研究二 不同剂量痰热清注射液对大鼠脑梗死体积的影响 |
| 1 引言 |
| 2 材料和方法 |
| 3 结果 |
| 4 讨论 |
| 研究三 痰热清注射液对apelin信号通路及细胞凋亡和自噬的影响 |
| 1 引言 |
| 2 材料和方法 |
| 3 结果 |
| 4 讨论 |
| 结语 |
| 创新点 |
| 存在的问题与不足 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 附录 |
| 在学期间主要研究成果 |
（4）3～8周龄攸县麻鸭苏氨酸需要量（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验设计和基础饲粮 |
| 1.2 饲养管理 |
| 1.3 测定指标与方法 |
| 1.3.1 生长性能 |
| 1.3.2 免疫器官指数 |
| 1.3.3 血清生化和抗氧化指标 |
| 1.4 数据统计分析 |
| 2 结果 |
| 2.1 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭生长性能的影响 |
| 2.2 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭免疫器官指数的影响 |
| 2.3 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭血清生化指标的影响 |
| 2.4 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭血清抗氧化指标的影响 |
| 2.5 3～8周龄攸县麻鸭苏氨酸需要量估测 |
| 3 讨论 |
| 3.1 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭生长性能和免疫器官指数的影响 |
| 3.2 饲粮苏氨酸水平对攸县麻鸭血清生化和抗氧化指标的影响 |
| 3.3 3～8周龄攸县麻鸭苏氨酸需要量 |
| 4 结论 |
（5）基于靶向代谢组学研究方法探究芍药内酯苷通过调节肠道菌群抗抑郁的机制（论文提纲范文）
| 中文摘要 |
| ABSTRACT |
| 英文缩略词表 |
| 前言 |
| 第一章 芍药内酯苷对慢性温和不可预知性应激抑郁模型大鼠快速起效作用 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 实验器材 |
| 1.2 药品与试剂 |
| 1.3 实验动物 |
| 1.4 实验方法 |
| 1.5 统计学方法 |
| 2.结果 |
| 2.1 芍药内酯苷连续给药7天对CUMS抑郁模型大鼠快速起效作用 |
| 2.2 芍药内酯苷单次剂量给药对CUMS抑郁模型大鼠快速起效作用 |
| 3.小结与讨论 |
| 第二章 芍药内酯苷的体内药代动力学研究 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 实验器材 |
| 1.2 药品与试剂 |
| 1.3 实验动物和样本收集 |
| 1.4 血浆样品处理方法 |
| 1.5 海马组织处理方法 |
| 1.6 色谱质谱条件 |
| 1.7 统计学方法 |
| 2.结果 |
| 2.1 芍药内酯苷在大鼠血浆中药代动力学研究 |
| 2.2 芍药内酯苷在大鼠脑海马组织中药代动力学研究 |
| 3.小结与讨论 |
| 第三章 芍药内酯苷对慢性温和不可预知性应激抑郁模型大鼠抗抑郁机制研究 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 实验器材 |
| 1.2 药品与试剂 |
| 1.3 实验动物 |
| 1.4 靶向代谢组学检测 |
| 1.5 蛋白质印迹表达分析(Western Blot) |
| 2.结果 |
| 2.1 芍药内酯苷调节CUMS抑郁症大鼠模型海马代谢紊乱 |
| 2.2 Western Blot蛋白表达分析 |
| 2.3 芍药内酯苷纠正慢应激大鼠的肠道菌群失调 |
| 3.小结与讨论 |
| 第四章 抗生素诱导的肠道菌群失调对芍药内酯苷抗抑郁作用的影响 |
| 1.材料与方法 |
| 1.1 实验器材 |
| 1.2 药品与试剂 |
| 1.3 实验动物 |
| 1.4 实验方法 |
| 1.5 粪便菌群DNA检测 |
| 1.6 靶向代谢组学检测 |
| 1.7 统计学方法 |
| 2.结果 |
| 2.1 抗生素诱导的微生物耗竭(AIMD) |
| 2.2 抗生素介导的CUMS菌群失调模型大鼠对芍药内酯苷治疗的影响 |
| 2.3 AIMD对芍药内酯苷治疗的CUMS模型大鼠抗抑郁作用影响 |
| 2.4 AIMD影响CUMS模型大鼠海马组织代谢水平 |
| 3.小结与讨论 |
| 全文讨论 |
| 结论 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 综述 从肠道微生态论治抑郁症 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（6）核心内源性网络假说与动力学方法在解析胰腺细胞命运决定和调控网络中的应用（论文提纲范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 缩略词 |
| 名词解释 |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 胰腺 |
| 1.1.1 成熟的胰腺细胞 |
| 1.1.2 胰腺细胞命运决定与胰腺疾病的联系 |
| 1.2 胰腺细胞的经典分化层次 |
| 1.2.1 胰腺细胞的经典分化层次模型 |
| 1.2.2 经典分化模型不能解释的现象之一——祖细胞的异质性 |
| 1.2.3 经典分化模型不能解释的现象之二——发育中的谱系转换 |
| 1.3 成熟胰腺中的谱系转换 |
| 1.3.1 成熟胰腺细胞的可塑性与谱系转换 |
| 1.3.2 ADM过程中谱系转换路径的争议 |
| 1.4 癌症的分子—细胞核心内源性网络假说 |
| 1.5 发育的分子—细胞核心内源性网络假说 |
| 1.5.1 发育的核心调控网络的普遍存在性 |
| 1.5.2 发育的核心内源性网络的特征 |
| 1.6 适应性景观 |
| 1.7 核心内源性网络的定量计算 |
| 1.7.1 发育的核心内源性网络定量计算框架 |
| 1.7.2 核心内源性网络定量计算方法 |
| 1.7.3 A型随机积分基础 |
| 1.7.4 与其它方法或模型的比较 |
| 1.8 基于scRNA-Seq数据的基因调控网络推断方法 |
| 1.9 论文结构 |
| 第二章 核心内源性网络塑造的适应景观决定胚胎期胰腺细胞复杂的命运决定路径 |
| 2.1 概述 |
| 2.2 简介 |
| 2.3 结果 |
| 2.3.1 胰腺发育的核心内源性网络的构建 |
| 2.3.2 核心内源性网络适应性景观的定量计算 |
| 2.3.3 已知的和之前未被认知的胰腺细胞类型被稳态和过渡态所预测 |
| 2.3.4 之前未被认知的祖细胞TrP和LEP介导早期内分泌谱系命运决定路径. |
| 2.3.5 解析hESC模型中β细胞成熟路径 |
| 2.3.6 解析腺泡和导管谱系早期完整命运决定路径 |
| 2.3.7 随机动力学模型下细胞命运决定的最大概率路径 |
| 2.4 材料与方法 |
| 2.4.1 布尔网络模型 |
| 2.4.2 粗粒化ODE模型 |
| 2.4.3 态间拓扑连接分析 |
| 2.4.4 A型随机积分下的最大概率路径 |
| 2.4.5 计算最大概率路径的离散格式 |
| 2.4.6 单细胞表达数据分析 |
| 2.4.7 数据获取地址 |
| 2.5 讨论 |
| 2.5.1 模型预测与验证 |
| 2.5.2 重新定义的胰腺细胞命运决定模型 |
| 2.5.3 核心内源性网络动力学模型与应用 |
| 2.6 本章小结 |
| 第三章 基于胰腺发育的核心内源网络动力学解析胰腺谱系转换路径 |
| 3.1 概述 |
| 3.2 简介 |
| 3.3 结果 |
| 3.3.1 解析细胞谱系转换的计算框架 |
| 3.3.2 不同谱系细胞间由一组过渡态和超过渡连接 |
| 3.3.3 一组超过渡态介导TiP和TrP的谱系转换 |
| 3.3.4 验证介导TiP和TrP谱系转换的超过渡态 |
| 3.3.5 模型预测出acinar向dutal细胞转换的并行路径 |
| 3.3.6 验证介导腺泡向导管细胞转换的中间态 |
| 3.4 材料和方法 |
| 3.4.1 核心内源性网络的粗粒化ODE方程 |
| 3.4.2 稳态、过渡态、超过渡态和它们之间的拓扑连接 |
| 3.4.3 单细胞数据分析 |
| 3.4.4 数据获取地址 |
| 3.5 讨论 |
| 3.5.1 模型预测与验证 |
| 3.5.2 ADM过程与正常发育中谱系转换可能享有共同路径 |
| 3.5.3 祖细胞的分化能力与过渡态和超过渡态的联系 |
| 3.5.4 核心内源性网络是决定适应性景观的分子基础 |
| 3.6 本章小结 |
| 第四章 一个基于scRNA-Seq数据推断基因调控网络的非线性动力学方法 |
| 4.1 概述 |
| 4.2 简介 |
| 4.3 材料和方法 |
| 4.3.1 基于Sigmoidal函数的单基因调控非线性动力学 |
| 4.3.2 模型中因果关系强弱的度量 |
| 4.3.3 数据集 |
| 4.3.4 预测效果的衡量方法 |
| 4.4 结果 |
| 4.4.1 胰腺发育的核心内源性网络中基因调控关系的预测 |
| 4.4.2 模型从非线性效应中准确地推断出调控关系 |
| 4.4.3 胰腺发育扩展网络中调控关系的预测 |
| 4.4.4 在其他胚胎发育过程中不同方法预测结果的比较 |
| 4.5 讨论 |
| 4.5.1 非线性动力学模型 |
| 4.5.2 全局调控网络非线性动力学的构造 |
| 4.6 代码可用性 |
| 4.7 本章小结 |
| 第五章 总结与展望 |
| 5.1 总结 |
| 5.2 论文的创新点 |
| 5.3 展望和有待解决的问题 |
| 5.3.1 胰腺发育核心内源性网络的扩展 |
| 5.3.2 其它器官或组织中的细胞命运决定 |
| 5.3.3 核心内源性网络的优化控制 |
| 5.3.4 胰腺导管细胞癌的内源性网络 |
| 5.3.5 核心内源性网络动力学计算框架在基于数据推断的调控网络上的应用 |
| 附录 |
| 附录A 第二章补充图表 |
| A.1 补充表2-1各种胰腺胰腺细胞的核心转录因子表达模式 |
| A.2 补充表2-2不同胰腺细胞类型的其它分子标志物 |
| A.3 补充图2-1核心内源性网络中的超过渡态(n=4) |
| A.4 补充图2-2稳态、过渡态和超过渡态的拓扑连接(n=4) |
| A.5 补充图2-3核心内源性网络中的稳态、过渡态和超过渡态(n=5) |
| A.6 补充图2-4核心内源性网络中的稳态、过渡态和超过渡态(n=6) |
| A.7 补充图2-5核心内源性网络中的稳态、过渡态和超过渡态(n=7) |
| A.8 补充图2-6核心内源性网络的布尔网络模型结果 |
| A.9 补充图2-7 PTF1A激活PDX1下核心内源网络中的稳态、过渡态和超过渡态(n=4) |
| A.10 补充图2-8 NKX6.1抑制ARX下核心内源网络中的稳态、过渡态和超过渡态(n=4) |
| A.11 补充图2-9预测的细胞类型的其它分子标志物表达模式 |
| A.12 补充图2-10 NKX6.1~+细胞的分子标志物表达模式 |
| A.13 补充图2-11小鼠胰岛α和β细胞的核心转录因子表达模式 |
| A.14 补充图2-12 PTF1A~+细胞的分子标志物表达模式 |
| A.15 补充图2-13腺泡scRNA-Seq数据分析验证AciP态的存在 |
| A.16 补充图2-14腺泡scRNA-Seq聚类分析显示基因组水平的差异 |
| 附录B 第三章补充图表 |
| B.1 补充图3-1包含超过渡态的胰腺细胞命运决定适应性景观 |
| B.2 补充图3-2类H1态和类H3态祖细胞的核心转录表达模式 |
| 附录C Boolean网络计算的MATLAB程序 |
| 枚举法计算网络中所有的稳态 |
| 附录D ODE模型的MATLAB计算程序 |
| 网络中稳态、过渡态和超过渡态间的拓扑连接计算 |
| 附录E Sigmoidal Function-Based Network Inference中MATLAB计算程序 |
| Sigmoidal Function-Based Network Inference主程序 |
| AUC计算程序 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 攻读博士期间已录用或已完成的工作 |
| 已发表文章 |
| 已投稿文章 |
| 准备投稿文章 |
| 附件 |
（7）鸡胚多肽调节免疫力功能的初步探究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 鸡胚蛋 |
| 1.1.1 概述 |
| 1.1.2 鸡胚蛋的营养成份 |
| 1.1.3 鸡胚蛋的研究现状 |
| 1.2 肽 |
| 1.2.1 概述 |
| 1.2.2 多肽的功能性研究 |
| 1.2.3 多肽的分离纯化研究 |
| 1.3 免疫系统 |
| 1.3.1 概述 |
| 1.3.2 免疫通路 |
| 1.4 研究目的、意义及内容 |
| 1.4.1 研究目的和意义 |
| 1.4.2 研究内容 |
| 第二章 鸡胚蛋白酶解工艺的优化 |
| 2.1 引言 |
| 2.2 实验部分 |
| 2.2.1 材料与试剂 |
| 2.2.2 仪器与设备 |
| 2.2.3 实验方法 |
| 2.2.4 结果与分析 |
| 2.3 本章小结 |
| 第三章 鸡胚多肽的初步分离及筛选 |
| 3.1 引言 |
| 3.2 实验部分 |
| 3.2.1 材料与试剂 |
| 3.2.2 仪器与设备 |
| 3.2.3 实验方法 |
| 3.2.4 结果与分析 |
| 3.3 本章小结 |
| 第四章 鸡胚多肽的免疫调节作用 |
| 4.1 引言 |
| 4.2 实验部分 |
| 4.2.1 材料与试剂 |
| 4.2.2 仪器与设备 |
| 4.2.3 实验方法 |
| 4.2.4 结果与分析 |
| 4.3 本章小结 |
| 第五章 结论 |
| 参考文献 |
| 致谢 |
| 作者简历 |
（8）维生素A对北京鸭生长发育和肠道健康的调节作用与机理研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 主要符号对照表 |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 维生素A在肠道吸收、转运和肝储存过程 |
| 1.2 维生素A的营养状况评价 |
| 1.3 维生素A对肠道粘膜的保护作用 |
| 1.3.1 肠粘膜介绍 |
| 1.3.2 维生素A与肠粘蛋白的合成 |
| 1.3.3 维生素A与肠道粘膜免疫 |
| 1.3.4 维生素A与内源性β-防御素的分泌 |
| 1.4 维生素A维持肠上皮屏障完整性及其机制 |
| 1.4.1 维生素A与肠上皮细胞增殖 |
| 1.4.2 维生素A与肠上皮细胞迁移 |
| 1.4.3 维生素A对肠上皮细胞间连接的影响 |
| 1.4.4 维生素A在细胞内的代谢及相关信号通路的影响 |
| 1.4.5 本研究的目的和意义 |
| 1.5 研究内容和技术路线 |
| 第二章 维生素A对北京鸭生长性能的影响 |
| 2.1 材料与方法 |
| 2.1.1 试验设计及饲养管理 |
| 2.1.2 试验材料及饲粮 |
| 2.2 测定指标及方法 |
| 2.2.1 生长性能的测定 |
| 2.2.2 屠宰性能的测定 |
| 2.2.3 血浆和肝脏中视黄醇浓度的测定 |
| 2.2.4 血浆生化指标的测定 |
| 2.3 数据处理 |
| 2.4 试验结果 |
| 2.4.1 日粮维生素A添加对北京鸭生长性能的影响 |
| 2.4.2 日粮维生素A添加对血浆和肝脏视黄醇浓度的影响 |
| 2.4.3 日粮维生素A添加对屠宰性能的影响 |
| 2.4.4 日粮维生素A水平对器官指数的影响 |
| 2.4.5 日粮维生素A对血浆脂质代谢相关指标的影响 |
| 2.4.6 生长前期北京鸭营养需要量 |
| 2.5 讨论 |
| 2.6 小结 |
| 第三章 维生素A对北京鸭肠粘膜发育的影响 |
| 3.1 材料与方法 |
| 3.1.1 试验材料 |
| 3.2 测定指标及方法 |
| 3.2.1 肠道组织形态学指标测定 |
| 3.2.2 肠粘膜酶活测定 |
| 3.2.3 十二指肠粘膜iTRAQ相对定量蛋白质 |
| 3.2.4 PRM相对定量分析目标差异蛋白质 |
| 3.2.5 数据统计与分析 |
| 3.3 结果与分析 |
| 3.3.1 维生素A对1~21日龄北京鸭肠组织形态学指标的影响 |
| 3.3.2 维生素A对1~21日龄北京鸭肠粘膜酶活性的影响 |
| 3.3.3 十二指肠粘膜差异表达蛋白质鉴定结果 |
| 3.3.4 十二指肠粘膜差异表达蛋白质的GO功能分析 |
| 3.3.5 十二指肠粘膜差异表达蛋白质的KEGG通路分析 |
| 3.3.6 PRM验证部分差异蛋白的表达 |
| 3.4 讨论 |
| 3.4.1 维生素A对肠粘膜发育的影响 |
| 3.4.2 维生素A对肠粘膜蛋白质表达的影响 |
| 3.5 小结 |
| 第四章 视黄酸对IPEC-J2细胞增殖和迁移的影响研究 |
| 4.1 材料与方法 |
| 4.1.1 试验材料 |
| 4.1.2 细胞培养 |
| 4.1.3 试验设计和处理 |
| 4.1.4 细胞增殖活性试验 |
| 4.1.5 RNA提取及RT-q PCR |
| 4.1.6 细胞迁移试验 |
| 4.1.7 Western Blot试验 |
| 4.1.8 双荧光素酶报告试验 |
| 4.1.9 数据处理 |
| 4.2 结果与分析 |
| 4.2.1 ATRA对 IPEC-J2 细胞增殖活性及增殖相关基因表达的影响 |
| 4.2.2 ATRA对 IPEC-J2 细胞迁移及迁移相关基因表达的影响 |
| 4.2.3 ATRA对 IPEC-J2 细胞ERK1/2 磷酸化水平的影响 |
| 4.2.4 ATRA对 ERK1/2 下游转录因子活性的影响 |
| 4.3 讨论 |
| 4.4 小结 |
| 第五章 维生素A对LPS刺激的北京鸭生产性能和肠道发育的影响 |
| 5.1 饲养试验材料与方法 |
| 5.1.1 试验设计与饲养管理 |
| 5.1.2 试验材料及饲粮 |
| 5.2 饲养试验测定指标及方法 |
| 5.2.1 生长性能的测定 |
| 5.2.2 屠宰性能测定和样品采集 |
| 5.2.3 血浆和肝脏中视黄醇含量的测定 |
| 5.2.4 血浆生化指标的测定 |
| 5.2.5 肠道形态指标测定 |
| 5.2.6 肠粘膜酶活测定 |
| 5.2.7 数据统计分析 |
| 5.3 细胞试验材料与方法 |
| 5.3.1 细胞培养 |
| 5.3.2 试验设计和处理 |
| 5.3.3 试验指标测定 |
| 5.4 试验结果 |
| 5.4.1 维生素A添加对1~21日龄北京鸭生产性能的影响 |
| 5.4.2 维生素A添加对1~21日龄北京鸭屠宰性能及组织视黄醇浓度的影响 |
| 5.4.3 维生素A添加对1~21日龄北京鸭器官指数的影响 |
| 5.4.4 维生素A对1~21日龄北京鸭血浆生化指标的影响 |
| 5.4.5 维生素A对1~21日龄北京鸭肠粘膜形态指标和二糖酶活性的影响 |
| 5.4.6 视黄酸和LPS对 IPEC-J2 细胞迁移及相关基因表达的影响 |
| 5.4.7 视黄酸和LPS对 IPEC-J2 细胞ERK1/2 信号通路的影响 |
| 5.4.8 视黄酸和LPS对转录因子NF-k B活性的影响 |
| 5.5 讨论 |
| 5.6 结论 |
| 第六章 全文结论 |
| 6.1 主要结论 |
| 6.2 主要创新点 |
| 6.3 有待进一步研究的问题 |
| 参考文献 |
| 附录A 血浆和肝脏视黄醇测定(HPLC紫外检测法) |
| 附录B 蛋白质定量和差异分析列表 |
| 附录C 组织切片制作和染色步骤 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（9）贴壁细胞迁移对于不同曲率信号的响应（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 符号列表 |
| 第1章 绪论 |
| 1.1 研究背景与意义 |
| 1.1.1 细胞与细胞外基质相互作用 |
| 1.1.2 几何信号对细胞行为的影响 |
| 1.1.3 细胞外基质微环境的构建方式 |
| 1.2 国内外研究现状 |
| 1.2.1 构建细胞外基质微环境的研究进展 |
| 1.2.2 几何信号对细胞行为调控的研究进展 |
| 1.3 本论文的主要研究内容 |
| 第2章 不同曲率基底的构建方式 |
| 2.1 引言 |
| 2.1.1 PDMS简介 |
| 2.1.2 掩膜版的设计 |
| 2.2 浇注模板的制作 |
| 2.2.1 电感耦合反应离子刻蚀 |
| 2.2.2 紫外曝光模板制作 |
| 2.3 小节 |
| 第3章 不同曲率信号对于细胞迁移行为的调控 |
| 3.1 引言 |
| 3.2 成像技术简介 |
| 3.3 实验方法 |
| 3.3.1 细胞培养 |
| 3.3.2 细胞实验 |
| 3.4 数据分析 |
| 3.4.1 运动速度的统计 |
| 3.4.2 运动轨迹的均方位移 |
| 3.4.3 方向比 |
| 3.4.4 运动方向的统计 |
| 3.4.5 细胞运动的方向自相关性 |
| 3.5 不同细胞在不同曲率衬底上运动方向性选择的微观解释 |
| 3.5.1 理论模型 |
| 3.5.2 细胞内微观结构观察 |
| 3.6 小节 |
| 第4章 结论与展望 |
| 参考文献 |
| 附录 |
| 个人简历及发表文章目录 |
| 致谢 |
（10）基于进化多目标优化的疾病模块识别算法研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第一章 绪论 |
| 1.1 研究背景与意义 |
| 1.2 国内外研究现状 |
| 1.2.1 传统疾病模块识别算法 |
| 1.2.2 基于进化多目标优化的疾病模块识别算法 |
| 1.2.3 可分类疾病模块识别算法 |
| 1.3 本文的工作与安排 |
| 第二章 疾病模块识别相关理论 |
| 2.1 相关生物数据 |
| 2.1.1 生物分子网络 |
| 2.1.2 疾病相关数据 |
| 2.2 算法评价机制 |
| 2.2.1 富集显着性 |
| 2.2.2 分类性能指标 |
| 2.2.3 功能富集分析 |
| 2.3 进化多目标优化算法相关理论 |
| 2.3.1 进化多目标优化算法的目标函数 |
| 2.3.2 进化多目标优化算法基本流程 |
| 2.3.3 基于支配关系的进化多目标优化算法选解策略 |
| 2.4 本章小结 |
| 第三章 基于个体特异性网络的进化多目标优化疾病模块识别算法 |
| 3.1 算法思想 |
| 3.2 算法流程 |
| 3.2.1 网络构造策略 |
| 3.2.2 疾病模块识别 |
| 3.3 实验与分析 |
| 3.3.1 实验设置 |
| 3.3.2 性能对比试验 |
| 3.3.3 网络构造策略的有效性分析 |
| 3.3.4 疾病模块的生物学分析 |
| 3.4 本章小结 |
| 第四章 基于进化多目标优化的可分类疾病模块识别算法 |
| 4.1 算法思想 |
| 4.2 算法流程 |
| 4.2.1 EMOCDMI的初始化策略 |
| 4.2.2 EMOCDMI的交叉变异算子 |
| 4.2.3 算法评价方法和目标函数 |
| 4.3 实验与分析 |
| 4.3.1 实验设置和实验数据集 |
| 4.3.2 实验结果与分析 |
| 4.4 本章小结 |
| 结论 |
| 工作总结 |
| 未来展望 |
| 参考文献 |
| 攻读硕士学位期间取得的学术成果 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目 |
| 致谢 |
四、用数学模型拟合鸡胚胸腺生长发育的研究（论文参考文献）
- [1]纳米化维生素E在肉鸡上应用效果的评估[D]. 李志朋. 西北农林科技大学, 2021
- [2]关节钙化软骨层通透性观测以及T型钙离子通道介导其发育的机制研究[D]. 黄杨. 中国人民解放军陆军军医大学, 2021(01)
- [3]痰热清注射液对脑梗死后apelin信号通路及细胞凋亡和自噬的影响[D]. 李中浩. 北京中医药大学, 2021(01)
- [4]3～8周龄攸县麻鸭苏氨酸需要量[J]. 黄璇,姚亚铃,李闯,张旭,蒋桂韬,胡艳,戴求仲. 动物营养学报, 2020(09)
- [5]基于靶向代谢组学研究方法探究芍药内酯苷通过调节肠道菌群抗抑郁的机制[D]. 付苏凝. 天津中医药大学, 2020(04)
- [6]核心内源性网络假说与动力学方法在解析胰腺细胞命运决定和调控网络中的应用[D]. 王俊强. 上海交通大学, 2020(01)
- [7]鸡胚多肽调节免疫力功能的初步探究[D]. 付劢. 中国农业科学院, 2020(01)
- [8]维生素A对北京鸭生长发育和肠道健康的调节作用与机理研究[D]. 冯宇隆. 中国农业科学院, 2020(01)
- [9]贴壁细胞迁移对于不同曲率信号的响应[D]. 于小雨. 中国科学院大学(中国科学院物理研究所), 2020(02)
- [10]基于进化多目标优化的疾病模块识别算法研究[D]. 苏晓春. 安徽大学, 2020(07)